1.1.1.3/1./24/A/034
"Imūnie un mikrobioma faktori, kas ierosina kuņģa atrofiju: ieskats no peļu modeļiem un pacientu audu telpiskās transkriptomikas"
Projekts tiek veikts Eiropas Reģionālā attīstības fonda (ERAF) 1.1.1.1. pasākuma "Praktiskas ievirzes pētījumi" 2. kārtas ietvaros.
Projekta identifikācijas Nr.: 1.1.1.1/18/A/089
Projekta izpildes termiņš: 2025. gada 1. maijs – 2028. gada 30. aprīlis
Projekta kopējais finansējums: 656 455 EUR EUR
Projekta zinātniskā vadītāja: Dr. biol. Vita Rovīte
Sadarbības partneris: SIA “GenEra” SIA «Rīgas Austrumu klīniskā universitātes slimnīca»
Projekta kopsavilkums:
Projekta mērķis ir izpētīt mikrobioma un imūnos faktorus, kas ietekmē kuņģa atrofiju un zarnu metaplāzijas veidošanos pacientu audu paraugos, kā arī peļu modeļos ar izraisītu parietālo šūnu atrofiju un cilvēka kuņģa mikrobioma transplantāciju, lai izstrādātu profilaktiskas stratēģijas Kuņģa Vēža (KV) transformācijas novēršanai. Pētījuma rezultāti sniegs būtiskus atklājumus KV pētniecības jomā, jo projekta laikā mēs novērtēsim KV attīstību vairākos līmeņos:
(1) mēs modulēsim un novērtēsim kuņģa audu mijiedarbību ar T šūnu ceļiem un kā tā var mainīt imūno mikrovidi, un identificēsim atrofijas aizkavēšanas faktorus,
(2) cilvēka mikrobioma transplantācijas modelī, kurā brīvas no mikroorganismiem peles kuņģī tiks izveidots specifisks mikrobioma profils, lai secinātu, kā konkrētas sugas ietekmē kuņģa audus, mēs potenciāli identificēsim jaunus, iespējami kaitīgus mikrobioma profilus turpmākai atrofijas intervences izpētei,
(3) izmantojot telpiskās transkriptomikas analīzi pacientu kuņģa audos ar zināmiem kuņģa mikrobioma profiliem, un saistot iegūtos datus ar peļu eksperimentu rezultātiem, mēs spēsim specifiski noteikt transkriptoma izmaiņas specifiskām kuņģa audu šūnu populācijām, ko varētu izmantot KA un KV ārstēšanas stratēģijām.
Informācija publicēta 06.05.2025.
Projekta progress:
2025. gada 1. maijs – 2025. gada 31. jūlijs
Šajā pārskata periodā uzsākta gatavošanās peļu eksperimentu īstenošanai. Veikta eksperimentu plānošana, notikusi sagatavošanās iepirkumu izsludināšanai, lai varētu iegādāties eksperimentiem nepieciešamos materiālus un reaģentus. Veikta papildus literatūras analīze. Sagatavots un iesniegts pieteikums Pārtikas un Veterinārā Dienesta dzīvnieku ētikas un labturības komitejai atļaujas saņemšanai plānoto dzīvnieku eksperimentu veikšanai. Paralēli, uzsāktas sarunas ar projektu patneriem par sekvencēšanas veikšanu ar SIA GENERA un ar SIA RAKUS par audu sagatavošanu un kvalitātes kontroli telpiskās transkriptomikas eksperimentiem.
Informācija publicēta 31.07.2025.